A 2009.évi Komjádi Kupa nevezési határideje 2009. október 26-a volt.
A sorsolásra 2009. november 9-én került sor.
A kupamérkőzések időpontjai:
2009. november 25. – csoportmérkőzések
2009. december 2. és 10. – negyeddöntők
2009. december 19. – elődöntők
2009. december 20. – döntő
A Komjádi Kupa nevezőit 4 csoportba sorsolták. A 2008. évi Komjádi Kupa 1.-4. helyezettjeit kiemelték (BVSC, Honvéd, Eger, Vasas), ők a csoportmérkőzéseken nem vettek részt, egyből a negyeddöntőben kapcsolódtak be.
A csoportmérkőzések egy napon, egy helyszínen kerültek sorra, a három fős csoportokban körmérkőzésekre került sor, a négy fős csoportban pedig egyenes kieséses rendszerben játszottak a csapatok.
A negyeddöntőben a négy csoportgyőztest a négy kiemelthez sorsolták. A mérkőzések oda-vissza alapon kerültek megrendezésre.
A negyeddöntő győztesei az elődöntőbe jutottak. Az elődöntő és a döntő Final Four rendszerben kerül megrendezésre egy helyszínen. Az első napon az elődöntőre kerül sor, azok győztesei a döntőbe jutnak, a vesztesek a 3. helyért játszanak.